У 1546 је основао град Арица на месту званом Ел Цхенцхорро. Педесет година касније град је био разорен од стране земљотреса и цунамија, што је натерало становнике да се креће своје домове у луку под заштитом Цапе Морро, на месту где је сада.

Садашња зграда катедрале Арица саграђена на рушевинама другог храма у граду, која је изграђена 1640. После 200 година радног стажа, ова црква је такође уништена у земљотресу 1868. године. Само сачувана каменим степеницама. Пројекат нове црквене зграде је наредио Перуа Жозе Балта у француском студију Густаве Еиффел, а првобитно био намењен одмаралишта Анкони. Али у 1875 одлучено је да се изгради у Арица. Годину дана касније, храм је одржан први мису.

Током Пацифиц Вар (1879-1883) је почео да припада граду Арица у Чилеу. Али до доласка двадесетог века, Арика остао под вођством Епархије Арекуипа, према декретом Ватикана. Године 1910., градоначелник града Арица, Макимо лира, наредио протеривање перуанске свештеника и његовог помоћника из земље. Они су замењени чилеанским војних свештеника.

Године 1911. црква је прикључен на епархије Тарапаца (сада - Епархија Икуикуе). И у 1959. је пребачен у чин катедрале. Са благословом папе Јована Павла ИИ 1986. године, је основан од стране Епархије Арица до центра града у катедрали Светог Марка у Арица.

Црква је релативно мала, у готском стилу. Дизајн цркве је у потпуности израђен од метала - греда, стубова, повезана шиљастим луковима, осим за два дрвена врата. Торањ храма уздиже ка небу, даје лепоту и раскош зграде, која је унапређена околни пејзаж: Плаза де Цолон, Цапе Морро де Арица, луке, луке и безграничну мора.

Године 1984. зграда катедрале прогласила националним спомеником Чилеу. И у 2002. години - историјски споменик Арица.