Музеј Авеиро је основан 1911. године и налази се у историјском згради бивше Доминиканске самостана Исуса. Манастир је подигнут у 1458. Фасада зграде које видимо данас датира из КСВИИИ века. Зграда има три улаза са лепим забата, и централна забат зграде је украшен са краљевским грбом. Близу улаза је споменик Саинт Гиованни (Јохн).

Атријум бивши манастир сада се користи као музејски лобију. Он је сачувао поглавље кућу у којој су одржани састанци, као и цркве, која датира из КСВ века, са стубовима у стилу ренесансе, као и неколико капеле у Мануелине стилу, украшена плочица "азулезусх." Унутрашњост главног капели цркве је украшена радовима дрвета са позлатом од КСВИ века. Зидови су украшени плочица "азулезусх", који приказује сцене из живота Светог Јуанс и обесити слике, који је приказао свеца.

На дну капеле, где је служио литургију, је гроб у којем леже посмртни остаци принцеза Јуанс, кћерка краља Алфонс В. гроб почео да гради по налогу краља Педро ИИ, али остаје принцеза вратила само у 1711. Гробница је украшен разнобојним мозаицима направљеним од италијанског мермера. Свака страна гроба је украшена панели приказују сцене из живота принцезе, плафон капеле је у барокном стилу. Дизајн краљевских гробница је радио као архитекта Мануел Антунес.

Принцеза Хуан је монашки постриг у 1472г. и живео у манастиру до своје смрти 1489. Била је позната по свом врлине, и, према легенди, она је повезана нека чуда. У 1673 је канонизовала као свеца Јуан.

Музеј има богату колекцију слика, скулптура, плочице, намештај, керамика барока.