Изградња манастира Нинна-ји почела је 886, један Емперор - Кеке и завршио две године након смрти другог претходника - Уда. Након абдикације цара Уда је пострижена монаха и отишао. С обзиром на то да је цар пензионисани живео овде до краја својих дана, манастир је био неформални назив "Старо Царска палата Омура." Званични назив Нинна-ји се преводи као "манастир хуманој хармонији."

Од оснивања храма, а до друге половине КСИКС века игуман манастира постали синови царева, који су монашки постриг по налогу својих очева.

Манастир је три пута полагао тест, ватре: ватру у 1119. комплекс је изгубио већину својих објеката, а у смутним временима Онин (1467-1477 година) на свом месту остао само пепео. Она је обновљена тек у КСВИИ веку, па чак и тада не у потпуности. Само колика је манастир власништва, према распореда 88 ходочашћа храмови некада стајао на њеној територији, који су постављени за башту. У 1887, део зграде изгорео Нинна-ји, али обнова почела је тек након више од две деценије.

Данас, Нинна-Ји је главни манастир Схингон будистичке секте, Омура и Укио се налази у старом јапанском граду. Главни храм Нинна-ји - статуа Буде Амида. Главни храм манастира Нинна-ји је УНЕСЦО Ворлд Херитаге Сите, а неки од њених објеката и занимљивости који се налазе у њој имају статус националне баштине у Јапану - нарочито Кондо - у главној сали храма, дрвена слика Буда слике на свили деити Кудзиаку и другима. Унутар храма је украшен јединственим платнима и другим уметничким делима.

Површина храма комплекса је подељен у неколико високих зидина. У југозападном делу рибњак и постоје павиљони, који чувају блага и древне уметничка дела. На северу је главни сала Кондо, пет-Тиеред Пагода и Вишњик, гдје већ дуги низ година гаји вишње сорту Омура да цвета после свега. Црква је школа Икебана Омура.