Када су шпански колонијални војници почели освајање Перуа, Куско је био један од бастиона власти у Царство Инка. Његови становници су жестоко бранили, двоструко град прошао из руке у руку пре него што су Инке повукли у 1536. Католичка црква реаговала веома озбиљно у изградњи катедрале у тако важном колонијалног града у региону. Катедрала Санто Доминго, то се зове катедрали Узнесења Блажене Дјевице Марије, подигнута је са бригом и пажњом за детаље, као и наставак изградње више од једног века. Данас катедрала је једна од најзначајнијих и најпопуларнијих туристичких дестинација у Куско, а због свог великог значаја у историји града, а због своје лепом архитектуром.

Током доласка шпански конквистадори у Куско, најважнији и истакнуте храмова у граду је Цорицанцха - храм посвећен богу сунца Инти. Многи историчари верују да је ово најсветије храм у Царство Инка. Шпанци одлучили на сајту храма Инка да се изгради своју катедралу, и користи истовремено највећи део грађевинског материјала, пролази кроз храм Цорицанцха. Данас, посетиоци могу и даље видите малу количину уништеним зидовима храма Инка у близини задњем делу катедрале.

Мала црква, позната као Триумпх цркве, изграђен 1536. године, убрзо након што је град био освојен. Али чим основан шпанске власти у овим областима, град је почео да се изгради много грандиозан и импресивне катедрале. Планови су припремљени од стране шпанског архитекте Хуан Мигел де Вераменди. Катедрала је саграђена у готском стилу и који је ренесансном типично за шпанске верске архитектуре у то време. Иако постоје неки знаци присуства утицаја Инка у верског симболизма зграде, укључујући главе јагуара на главна врата катедрале. Изградња катедрале је почела у 1559. Већина становништва Инка је коришћен за напорним радом током изградње храма.

Вековима је катедрала је постала дом неколико важних верских предмета, укључујући и чувену статуу Црног Христа, који је замраченој од свијеће за неколико векова. Верује се да је ова статуа је помогла црква опстане и да истрају после разорног земљотреса у 1650. Са десне стране је велика кула од катедрале звона Мариа Ангола Белл, висок 2 метра, тежине око 6 тона. Његова звони се може чути на удаљености од двадесет километара. Саборна црква чува импресивну колекцију уметности простире неколико векова, укључујући и сликама у 1650, који су најстарији у граду.