Зграда синагоге у граду Томар се сматра једним од највише добро очувана у Португалу сличних објеката изграђених у средњем веку. Синагога се налази у историјском центру града. Важно је напоменути да постоји мала синагога у јеврејском музеју, који привлачи велики број туриста.

Томар Синагога је саграђена средином КСВ вијека, Јеврејске заједнице града. Ако погледате у згради од споља, синагога није издваја међу осталим кућама на улици. Модерна главни улаз у синагоги је касније изграђена и иде у северном делу улице. У средњем веку главни улаз је дизајниран као ланцетастим готске лукова и отишао у источном делу улице у правцу Јерусалима.

Кроз улаз, посетиоци уђу у дворану квадратном. Три стране наоса су одвојене четири стуба који подржавају сводови у готском стилу. Престоницама колона су украшене геометријским орнаментима и цветним. Током ископавања за изградњу синагоге су открили остатке миквах, ритуално базен прописан јеврејском закону.

У 1496., када је прогон Јевреја је живео у Португалији, у синагоги је био затвор. Касније, било је црква, а онда је складиште. У 30 година двадесетог века стара синагога зграда је купио пољски научник Семјуел Сцхвартз. Он је обновио изградњу и донирала га португалске владе под условом да ће отворити музеј. Године 1939., синагога је отворио Јеврејски музеј Абрахам Зацуто, који је био познати астроном у средњем веку. Међу експонатима - стећака. Један од најпознатијих експоната сматра камену, која датира из 1308 године и довео из Лисабона синагоги.