У 1921., након приступања Трансилваније у Румунији, у складу са одредбама Уговора о приступању Румуније током Првог свјетског рата у 1872. основао Универзитет у Клужу (Цлуј-Напоца касније) у Трансилванији са наставом на мађарском језику је пребачен у Сегедину. До 1940. године, универзитет обука је спроведена у четири факултета: медицина, математика и наука, права, и Факултет уметности, језика и историје. У овом тренутку, један од универзитетских професора је Алберт Сент-Ђерђ - Добитник Нобелове награде за физиологију или медицину 1937. године.

  У 1940. је, према одлуци Бечке награде, Румунија дуговао да уступи део Трансилваније, Мађарске, а универзитет је назад у Клуж, што је и учињено пребачен, али у исто време у Сегедину је отворен нови краљевски Универзитет у Миклош Хорти, који После рата, он је именован Универзитета у Сегедину. У 1951., Медицински факултет је укинута - у корену је основана Медицал Институте. Године 1962., Универзитет проглашена је мађарски револуционар песник Атила Јожеф, који је 1924. године ушао Универзитета у Сегедину, али је избачен због својих политичких песама.

  У 2000. години, Универзитет у Сегедину је чекао нову реорганизацију, која се одиграла као резултат уједињења Универзитета, Медицинског факултета и неколико других институција у једној Универзитета у Сегедину.

Једна од атракција у Саборној тргу - музички сат постављен на зиду једне универзитетске зграде испред Катедрале. Ово јединствено сат - ради Ватцхмакер Франз Тсури и древоруб Јозеф Цулае.